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时间又过去了半分多钟，而离尼奥进入代码之源的时间仅仅剩下了不到三十秒！
“母体通信中枢的通路已经连通，快点进去。”介于矩阵与母体之间的机器城虚拟空间中，梅罗纹奇拉开了一扇门，对连冰催促道。
母体，由于连冰和梅罗纹奇阻止了史密斯附体的班尼，维奇里安号的泰伦和他的船员因此躲过了死亡的命运，代码之源所处大楼的备用电源被成功炸毁，崔尼蒂也躲过了差点被特警杀死的命运。
一个不大不小的变化，足以改变尼奥的最初选择，只是此时的尼奥并不知道，他已经因为连冰的原因，而不需要在拯救崔尼蒂还是人类的未来之间进行抉择。
母体的通信中枢中，尼奥和制匙人进入其中，白色的走廊通道，墙壁上无数的房门，似曾相识的感觉，让尼奥觉得就如同会见先知时守护天使带他走过的的通道一般。
忽然，无数的史密斯从墙壁两旁的房门中冲的出来！
制匙人见状，拿出一串钥匙，打开一道房门钻了进去，尼奥却被无数的史密斯拦住，脱不开身。
就在这时，墙壁上的一道房门被推开，连冰和克莉斯汀娜也进入了这里，看着无数的史密斯，连冰眉头微皱。
通道的另一端，一个房门再次打开，制匙人出现在里面，正要向尼奥招手，却忽然看见多出来的连冰和克莉斯汀娜，楞在了那里。
连冰却不顾他的神色，与克莉斯汀娜一起，直接撞开无数的史密斯，顺带拉上尼奥，直接向着制匙人所在的房门冲了上去。
两个史密斯拔出手枪，制匙人此时也顾不上许多，赶紧关上房门。
枪声响起，在关上房门的瞬间，子弹射穿了房门，在与外界通道的连接完全断开之前，讲制匙人打成了筛子。
代表这个通道的房门被关闭，制匙人从脖子上拔下项链挂着的钥匙，在连冰的神经元意识能力的眼中那个，此时的制匙人的核心代码已经转移到了那把钥匙中。
原来，制匙人的核心代码才是真正代码之源的进入密码！
不过，这时连冰却不关心制匙人的死活，而是对克里斯汀娜道：“下手！”
克里斯汀娜闻言，猛的伸出手来钳住尼奥的双臂，一种金色的流质随着克里斯汀娜抓住尼奥的手臂上，向这他全身蔓延上去。
“史密斯……为什么……”尼奥遭到突然袭击，只来得及说出几个字，整个身体就几乎被金色的流质完全覆盖。
这些金色的流质其实就是克里斯汀娜的入侵数据流，入侵解析和掌握了史密斯核心代码后，用于史密斯与尼奥救世主代码赫然相反的核心代码进行中和。
源自克里斯汀娜的金色入侵数据流，眼看就要将尼奥完全覆盖，一旦完成，尼奥就将彻底的没有还手之力，然而，救世主尼奥的核心代码以及在母体的权限，似乎比此时克里斯汀娜掌握的还要强大，居然并没有完全被中和掉。
就在只差一点的时候，金色的数据流竟然开始逆流，连冰眉头一皱，不敢怠慢，立刻加入了对尼奥的压制，身上绽放出金色的光芒，与克里斯汀娜的金色数据流合一，再次将尼奥压制下去。
在克里斯汀娜的感觉中，对尼奥的入侵中和似乎过了很久，其实也才仅仅数秒而已，有了连冰的帮助，克里斯汀娜终于完全中和了尼奥的核心代码，并掌握了这个由所有非法程序衍生的最高形态。
“尼奥，抱歉了，为了获得大量的功勋点和降临剧情，就必须干掉你，拥有了你和史密斯的核心代码，虽然没有矩阵的权限可以删除点史密斯，不过却能让设计师妥协，甚至得以脱离程序虚拟空间，完全打乱剧情，所以，你只好去死了！”连冰心中暗道一声，虽然干掉了尼奥还是没收到奇迹之门的提示，不过现在已经事已至此，也只能继续下去！
心下想着，手上却是不停，拿过制匙人手中的钥匙，插入了代码之源的大门。
一阵白色的光芒过后，连冰和克里斯汀娜的眼前出现了一个布满屏幕的房间，设计师坐在沙发上转了过来，笔挺的白色西装，满头的白发梳理的井井有条，精神抖擞，高高在上的神情，让人忽视他形象的年龄。
见到进来的不是救世主尼奥，而是连冰和克里斯汀娜，却半点也不见异色：“不论你们是怎么来到这里，作为非法程序的你们，既然敢进入代码之源，就一定掌握了与我抗衡的能力。”