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调整中最大的变化是确定了政务院协理大臣、军务院军机大臣的品级。在以往的内阁中内阁阁臣的品级为正五品，为了提高他们的身份又各自加官加衔很麻烦也很搞笑，这次调整中明确规定政务院协理大臣和军务院军机大臣都为正二品不再加衔，各部尚书、各省总督还有都察院都御史都为正二品，各部侍郎、副都御史、各省巡抚都为正三品。
以前总督、巡抚、总兵都不是固定的官，由京中派员兼任，地方上的布政使、按察使就成了总督巡抚的帮手，这官是越来越多能负责人的人是越来越少。各省的都指挥使更是成了管兵不练兵的人，把好好的士兵一个个都整成了只会种田的农夫，调整后各省增添正二品总兵一名，总兵之下为三品参将、四品游击、五品千户、六品百户。
这样一来把流动的职位变成固定的职位就好管理一些，一个省最高官员为总督负责全面，巡抚管民政总兵管军务，废除了各省的布政使、按察使、都指挥使等官职。为了加强中央对地方的控制力度，都察院又派出常年在外专门巡查各县的六品巡按御史，如现州府官员有不法行为就上奏由都察院派出四品签都御史专办，这样一来就避免了小官管大员的尴尬事。
二月底，新的职位、品级等调整半月后，见各地都没有人提出异议，天启决定让军务院调整一下各地武将的分工。由于南方奢崇明、安邦彦等叛乱还没有完全平定，内地的卫所也调整得不彻底，能调整的就调整不能调整的就暂时保持原样，这次调整就只围绕着辽东而来。
知道军务院已经根据自己的意思划分了区域，但具体的人员安排还要自己去定，天启这天一早就来到军务院跟大家会商。待大家都坐下后天启见这次人来的非常齐全，辽东的官员除了熊廷弼和王化贞驻守宁远关和宁远城，毛文龙驻守皮岛外，其他人基本上都来了。
孙承宗先说道：“遵皇上旨意，在蓟镇再设立一个军事管制区，这个新的军事管制区包括密云与古北口之间和遵化与喜峰口之间的地域，治所在蓟州。其主要目的就是面向草原训练一支骑兵为主山地步兵为辅的军队，随时准备防备和出击。”
见大家都在听，孙承宗接着说道：“遵皇上旨意，设立以天津为治所的渤海军区，其军队以海上水师为主兼管运河河防。原辽西军事管制区不变，以山地步兵为主，少量水师和骑兵为辅。这三个地方分别派驻督军、巡抚和总兵，今天召集大家来就是看大家自愿去哪里，军务院综合大家的意见后由皇上决定任命。”
在半年前天启就规定了，政务院管理任命除协理大臣外的所有朝中文官，只需要事后奏报，而军务院关于各地将领的任命必须先由天启过目同意。因为文官再坏破坏力也不大，而武将选不好那破坏力是相当的惊人，事关国运不得不小心谨慎。
见孙承宗说完天启说道：“朕的意思是你们自己根据各人的条件和兴趣挑选，但并不是说你选了就会任命你，朕会在有意愿的人中选出最适合的人，先说三个地方的督军职务，这个督军属于正二品管军务也协调与军务有关的地方事务，你们谁先来自我推荐？”
既然是正二品又跟地方事务有联系，自然只有几位军机大臣有资格竞争，在以往还可能有人试图通过争职务来给自己提品级，但自从天启限制了年龄和品级的关系后，年轻又有野心的人也就彻底死了心。在将官员的年龄和品级挂钩前，考虑到武将跟文官不一样，文官用智武将用力，所以纯粹的武将比如说总兵、副将、参将、游击等职务不受年龄限制，但只要跟文职沾边的职务比如说督师、巡抚等在年龄限制上最多放宽一级。
这样做是好是坏先无法定论，但至少少了几分浮躁多了几分沉稳。